MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 32264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022521	GCT	2	6	260788	260793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5002	NC_022521	CCT	2	6	260802	260807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5003	NC_022521	CCT	2	6	260814	260819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5004	NC_022521	TCC	2	6	260887	260892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5005	NC_022521	CTC	2	6	260952	260957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5006	NC_022521	CTC	2	6	260964	260969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5007	NC_022521	CGG	2	6	261002	261007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454921
5008	NC_022521	GGC	2	6	261024	261029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454921
5009	NC_022521	GAG	2	6	261033	261038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454921
5010	NC_022521	CCT	2	6	261098	261103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5011	NC_022521	TTA	2	6	261119	261124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454921
5012	NC_022521	TAT	2	6	261153	261158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454921
5013	NC_022521	TCC	2	6	261199	261204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5014	NC_022521	GGCT	2	8	261230	261237	0 %	25 %	50 %	25 %	549454921
5015	NC_022521	TCC	2	6	261259	261264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5016	NC_022521	CTC	2	6	261376	261381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5017	NC_022521	TCC	2	6	261415	261420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5018	NC_022521	GCA	2	6	261434	261439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5019	NC_022521	ACG	2	6	261451	261456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5020	NC_022521	CCT	2	6	261561	261566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5021	NC_022521	CTC	2	6	261598	261603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5022	NC_022521	AGG	2	6	261604	261609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454921
5023	NC_022521	GAA	2	6	261612	261617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454921
5024	NC_022521	CTA	2	6	261644	261649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454921
5025	NC_022521	CTC	2	6	261760	261765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5026	NC_022521	GCC	2	6	261771	261776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454921
5027	NC_022521	C	6	6	261841	261846	0 %	0 %	0 %	100 %	549454921
5028	NC_022521	CTC	2	6	261858	261863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5029	NC_022521	CTGC	2	8	261936	261943	0 %	25 %	25 %	50 %	549454921
5030	NC_022521	CCTC	2	8	262025	262032	0 %	25 %	0 %	75 %	549454921
5031	NC_022521	CGA	2	6	262061	262066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5032	NC_022521	GGT	2	6	262074	262079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454921
5033	NC_022521	TCC	2	6	262174	262179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5034	NC_022521	C	6	6	262199	262204	0 %	0 %	0 %	100 %	549454921
5035	NC_022521	G	6	6	262355	262360	0 %	0 %	100 %	0 %	549454921
5036	NC_022521	GAC	2	6	262380	262385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5037	NC_022521	CCA	2	6	262418	262423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454921
5038	NC_022521	TCC	2	6	262426	262431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5039	NC_022521	GCTG	2	8	262460	262467	0 %	25 %	50 %	25 %	549454921
5040	NC_022521	GGA	2	6	262481	262486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454921
5041	NC_022521	C	6	6	262558	262563	0 %	0 %	0 %	100 %	549454921
5042	NC_022521	ACCCTC	2	12	262564	262575	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	549454921
5043	NC_022521	GTG	2	6	262633	262638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454921
5044	NC_022521	AGG	2	6	262648	262653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454921
5045	NC_022521	AT	3	6	262689	262694	50 %	50 %	0 %	0 %	549454921
5046	NC_022521	TCC	2	6	262702	262707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454921
5047	NC_022521	GGA	2	6	262769	262774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454921
5048	NC_022521	AGC	2	6	262792	262797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5049	NC_022521	CTT	2	6	262812	262817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454921
5050	NC_022521	CCA	2	6	262824	262829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454921
5051	NC_022521	GTC	2	6	262845	262850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5052	NC_022521	TCG	2	6	262930	262935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5053	NC_022521	CA	3	6	263071	263076	50 %	0 %	0 %	50 %	549454921
5054	NC_022521	ACG	2	6	263107	263112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454921
5055	NC_022521	G	6	6	263170	263175	0 %	0 %	100 %	0 %	549454921
5056	NC_022521	CTT	2	6	263193	263198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454921
5057	NC_022521	CCT	2	6	263408	263413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454922
5058	NC_022521	TGG	2	6	263417	263422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454922
5059	NC_022521	TCCAC	2	10	263429	263438	20 %	20 %	0 %	60 %	549454922
5060	NC_022521	CCT	2	6	263477	263482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454922
5061	NC_022521	AGG	2	6	263512	263517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454922
5062	NC_022521	CGA	2	6	263522	263527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454922
5063	NC_022521	GGT	2	6	263555	263560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454922
5064	NC_022521	CTC	2	6	263592	263597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454922
5065	NC_022521	TCG	2	6	263617	263622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454922
5066	NC_022521	GTA	2	6	263634	263639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454922
5067	NC_022521	CCG	2	6	263660	263665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454922
5068	NC_022521	TCAA	2	8	263888	263895	50 %	25 %	0 %	25 %	549454923
5069	NC_022521	AAG	2	6	263897	263902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454923
5070	NC_022521	TCC	2	6	263932	263937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454923
5071	NC_022521	GC	3	6	264037	264042	0 %	0 %	50 %	50 %	549454923
5072	NC_022521	GGC	2	6	264044	264049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454923
5073	NC_022521	G	6	6	264115	264120	0 %	0 %	100 %	0 %	549454923
5074	NC_022521	AGG	2	6	264121	264126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454923
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5078	NC_022521	CGT	2	6	264206	264211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454923
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5081	NC_022521	CTC	2	6	264400	264405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454924
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5083	NC_022521	CCCACG	2	12	264575	264586	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	549454925
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5085	NC_022521	G	7	7	264598	264604	0 %	0 %	100 %	0 %	549454925
5086	NC_022521	GCT	2	6	264640	264645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454925
5087	NC_022521	GAG	2	6	264670	264675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454925
5088	NC_022521	CGG	2	6	264692	264697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454925
5089	NC_022521	GAAG	2	8	264754	264761	50 %	0 %	50 %	0 %	549454925
5090	NC_022521	G	7	7	264768	264774	0 %	0 %	100 %	0 %	549454925
5091	NC_022521	GA	3	6	264891	264896	50 %	0 %	50 %	0 %	549454925
5092	NC_022521	CAG	2	6	264903	264908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454925
5093	NC_022521	GATTG	2	10	264916	264925	20 %	40 %	40 %	0 %	549454925
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5100	NC_022521	AGG	2	6	265248	265253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454926
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5102	NC_022521	CAT	2	6	265399	265404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454926
5103	NC_022521	TAC	2	6	265418	265423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454926
5104	NC_022521	CGA	2	6	265432	265437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454926
5105	NC_022521	AAT	2	6	265525	265530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454926
5106	NC_022521	AGG	2	6	265604	265609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454926
5107	NC_022521	GGCT	2	8	265780	265787	0 %	25 %	50 %	25 %	549454927
5108	NC_022521	G	7	7	265973	265979	0 %	0 %	100 %	0 %	549454927
5109	NC_022521	AGG	2	6	265980	265985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454927
5110	NC_022521	CGC	2	6	265994	265999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454927
5111	NC_022521	CCTC	2	8	266020	266027	0 %	25 %	0 %	75 %	549454927
5112	NC_022521	CTC	2	6	266120	266125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454927
5113	NC_022521	TGGAG	2	10	266152	266161	20 %	20 %	60 %	0 %	549454927
5114	NC_022521	AGTA	2	8	266186	266193	50 %	25 %	25 %	0 %	549454927
5115	NC_022521	CTC	2	6	266201	266206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454927
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5117	NC_022521	TC	3	6	266223	266228	0 %	50 %	0 %	50 %	549454927
5118	NC_022521	CCG	3	9	266419	266427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454927
5119	NC_022521	AGG	2	6	266461	266466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454927
5120	NC_022521	TA	3	6	266500	266505	50 %	50 %	0 %	0 %	549454927
5121	NC_022521	CGA	2	6	266539	266544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454927
5122	NC_022521	CCTT	2	8	266615	266622	0 %	50 %	0 %	50 %	549454927
5123	NC_022521	TAG	2	6	266638	266643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454927
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5135	NC_022521	CTT	2	6	267503	267508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454928
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5139	NC_022521	GCC	2	6	267623	267628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454928
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5143	NC_022521	CTC	2	6	267794	267799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454928
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5243	NC_022521	CT	3	6	271450	271455	0 %	50 %	0 %	50 %	549454932
5244	NC_022521	CCT	2	6	271458	271463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454932
5245	NC_022521	GTC	2	6	271466	271471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454932
5246	NC_022521	TAT	2	6	271501	271506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454932
5247	NC_022521	GCT	2	6	271603	271608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454932
5248	NC_022521	GCC	2	6	271708	271713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454932
5249	NC_022521	TCT	2	6	271731	271736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454932
5250	NC_022521	GTA	2	6	271747	271752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454932
5251	NC_022521	CCA	2	6	271839	271844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454932
5252	NC_022521	CTT	2	6	271909	271914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454932
5253	NC_022521	CGCC	2	8	271920	271927	0 %	0 %	25 %	75 %	549454932
5254	NC_022521	CCA	2	6	271965	271970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454932
5255	NC_022521	TAGG	2	8	272013	272020	25 %	25 %	50 %	0 %	549454932
5256	NC_022521	AGG	2	6	272042	272047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454932
5257	NC_022521	GA	3	6	272051	272056	50 %	0 %	50 %	0 %	549454932
5258	NC_022521	CT	3	6	272069	272074	0 %	50 %	0 %	50 %	549454932
5259	NC_022521	GAG	2	6	272083	272088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454932
5260	NC_022521	GAG	2	6	272149	272154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454932
5261	NC_022521	GCCT	2	8	272169	272176	0 %	25 %	25 %	50 %	549454932
5262	NC_022521	GTAGG	2	10	272212	272221	20 %	20 %	60 %	0 %	549454932
5263	NC_022521	ATC	2	6	272266	272271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454932
5264	NC_022521	CTC	2	6	272282	272287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454932
5265	NC_022521	ATC	2	6	272336	272341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454932
5266	NC_022521	CTGTGG	2	12	272342	272353	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549454932
5267	NC_022521	TCG	2	6	272414	272419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454932
5268	NC_022521	CCT	2	6	272479	272484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454932
5269	NC_022521	TAA	2	6	272523	272528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454932
5270	NC_022521	AGCT	2	8	272566	272573	25 %	25 %	25 %	25 %	549454932
5271	NC_022521	CAT	2	6	272680	272685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454932
5272	NC_022521	TC	3	6	272824	272829	0 %	50 %	0 %	50 %	549454932
5273	NC_022521	TCT	2	6	272934	272939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454932
5274	NC_022521	CAGG	2	8	272940	272947	25 %	0 %	50 %	25 %	549454932
5275	NC_022521	CATCC	2	10	273046	273055	20 %	20 %	0 %	60 %	549454933
5276	NC_022521	GC	3	6	273062	273067	0 %	0 %	50 %	50 %	549454933
5277	NC_022521	TCC	2	6	273088	273093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454933
5278	NC_022521	GTC	2	6	273144	273149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454933
5279	NC_022521	TGATA	2	10	273154	273163	40 %	40 %	20 %	0 %	549454933
5280	NC_022521	GGC	2	6	273167	273172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454933
5281	NC_022521	AGG	2	6	273193	273198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454933
5282	NC_022521	GA	3	6	273213	273218	50 %	0 %	50 %	0 %	549454933
5283	NC_022521	GCC	2	6	273371	273376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454933
5284	NC_022521	C	6	6	273395	273400	0 %	0 %	0 %	100 %	549454933
5285	NC_022521	CTC	2	6	273423	273428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454933
5286	NC_022521	C	6	6	273458	273463	0 %	0 %	0 %	100 %	549454934
5287	NC_022521	CTC	2	6	273549	273554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454934
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5289	NC_022521	ATA	2	6	273624	273629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454934
5290	NC_022521	GCTG	2	8	273637	273644	0 %	25 %	50 %	25 %	549454934
5291	NC_022521	CCT	2	6	273653	273658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454934
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5294	NC_022521	CAG	2	6	273725	273730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454934
5295	NC_022521	CTA	2	6	273754	273759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454934
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5298	NC_022521	CCT	2	6	273999	274004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454934
5299	NC_022521	C	6	6	274005	274010	0 %	0 %	0 %	100 %	549454934
5300	NC_022521	ACA	2	6	274014	274019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454934
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5303	NC_022521	GCT	2	6	274400	274405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454935
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5312	NC_022521	ATC	2	6	274666	274671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454936
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5314	NC_022521	GTA	2	6	274748	274753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454936
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5318	NC_022521	ATA	2	6	275064	275069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454936
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5320	NC_022521	CCTC	2	8	275102	275109	0 %	25 %	0 %	75 %	549454936
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5325	NC_022521	TCC	2	6	275170	275175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454936
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5329	NC_022521	TCG	2	6	275237	275242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454936
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5333	NC_022521	CTC	3	9	275389	275397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454937
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5335	NC_022521	CGCT	2	8	275522	275529	0 %	25 %	25 %	50 %	549454937
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5351	NC_022521	GAA	2	6	276130	276135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454937
5352	NC_022521	CTC	4	12	276184	276195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454937
5353	NC_022521	GCCT	2	8	276209	276216	0 %	25 %	25 %	50 %	549454937
5354	NC_022521	GCC	2	6	276227	276232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454937
5355	NC_022521	TGT	2	6	276237	276242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454937
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5357	NC_022521	CAG	2	6	276354	276359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454937
5358	NC_022521	TC	3	6	276383	276388	0 %	50 %	0 %	50 %	549454937
5359	NC_022521	CTC	2	6	276391	276396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454937
5360	NC_022521	ATCT	2	8	276400	276407	25 %	50 %	0 %	25 %	549454937
5361	NC_022521	TCC	2	6	276461	276466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454937
5362	NC_022521	CCCTCC	2	12	276582	276593	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	549454937
5363	NC_022521	CT	3	6	276596	276601	0 %	50 %	0 %	50 %	549454937
5364	NC_022521	CTA	2	6	276621	276626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454937
5365	NC_022521	TCG	2	6	276629	276634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454937
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5367	NC_022521	AGG	2	6	276665	276670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454937
5368	NC_022521	AT	3	6	276687	276692	50 %	50 %	0 %	0 %	549454937
5369	NC_022521	GCT	2	6	276781	276786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454938
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5462	NC_022521	TA	3	6	281663	281668	50 %	50 %	0 %	0 %	549454942
5463	NC_022521	TCA	2	6	281673	281678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454942
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5474	NC_022521	A	6	6	282222	282227	100 %	0 %	0 %	0 %	549454943
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5476	NC_022521	CT	3	6	282807	282812	0 %	50 %	0 %	50 %	549454944
5477	NC_022521	GAG	2	6	282833	282838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454944
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5480	NC_022521	CCT	2	6	282884	282889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454944
5481	NC_022521	TAT	2	6	282905	282910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454944
5482	NC_022521	TGT	2	6	283068	283073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454945
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5484	NC_022521	GTA	2	6	283235	283240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454945
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5486	NC_022521	GA	3	6	283311	283316	50 %	0 %	50 %	0 %	549454945
5487	NC_022521	TA	3	6	283371	283376	50 %	50 %	0 %	0 %	549454945
5488	NC_022521	TAGA	2	8	283383	283390	50 %	25 %	25 %	0 %	549454945
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